想要保存蛋黃醬的最佳風味，推薦將蛋黃醬置於一個溫度略低於室溫的陰涼處。傢裡不巧沒有陰涼處的人雖然可以將蛋黃醬保存在冰箱裡，但最好將蛋黃醬放在不被冷氣直吹、溫度相對高一點的地方。許多人會想到冰箱門背後的位置，然而冰箱的冷氣循環方式因其制造商的設計不同而不同，所以冰箱門背後的位置可能也會是溫度較低的地方，甚至可能在0度以下，也請務必註意這一點。因此，冰箱中的蛋黃醬最佳保存地點是冰箱中溫度不會過低、冷氣也不會直吹的“蔬菜保存室”。
蛋黃醬有一定的殺菌和防腐作用，所以常溫保存也不會有太大的問題。但為瞭能品嘗到最美味的蛋黃醬，請大傢一定要註意妥善保存。
