1、屬性關系。柚子的品種有很多，文旦是柚子的一種，文旦主要有玉環文旦、麻豆文旦等，柚子則多指紅心柚和黃心柚。
2、產地區別。柚子品種豐富，一般分佈在我國長江以南各地；文旦產福建（莆田仙遊一帶）、臺灣、浙江等有栽種，其中玉環文旦、麻豆文旦較為出名；果大，單果重1250~2000克，最大可達3500克以上，肉質脆嫩，有香氣。
3、外形口感區別。柚子果形偏扁、偏大，肉質顆粒也比較大，果色偏黃，果皮較厚，呈黃色；文旦果形上小下大，較為修長，有點像葫蘆，果色綠中泛黃，果皮較薄，呈淺綠色。
4、口感區別。柚子口感微帶有苦味，酸味較多；文旦柚更多的是甘甜多汁，果肉細膩，並且籽小、少。
文旦柚在柚子當中算是佳品，自然價格也會比普通的柚子更貴瞭，而且文旦柚的皮做成菜，常吃可理氣化、潤肺清腸。
