1、正常情況下，人吃進體內的植物蛋白經過代謝後，大部分會成為含氮廢物，經腎臟排出體外。但很多人的腎臟（特別是老年女性）並不是很好，排泄廢物的能力下降，他們如果大量食用豆腐，攝入過多的植物性蛋白質就會在體內生成更多的含氮廢物，從而加重腎臟負擔，促使腎功能進一步衰退。
2、豆腐含有極為豐富的蛋白質，一次食用過多將阻礙人體對鐵的吸收，並易引起蛋白質消化不良，造成腹脹，腹瀉；豆腐中的大量蛋氨酸在酶的作用下可轉化為半胱氨酸，半胱氨酸會損傷動脈管壁內皮細胞，使膽固醇和甘油三酯易於沉積於動脈壁上，促使動脈硬化形成；豆腐含有大量嘌呤，嘌呤代謝易造成痛風發作。
3、食用豆腐時要註意食品安全。有包裝的豆腐很容易腐壞，購買後應立刻浸泡在水中，放入冰箱冷藏，烹調前再取出。豆腐中缺少人體必需的氨基酸——蛋氨酸，烹制時適宜與肉類、蛋類食物搭配，可大大提高豆腐中蛋白質的利用率。
