1、根據結局動畫以及過場戰鬥來看，薑世離與魔翳操縱的涅世穹兵同歸於盡而元神徹底消散，魔翳也因為力量耗盡而死去。魔翳臨死前希望龍幽一定要想辦法解決魔界幹旱的問題，龍幽答應後魔翳心願已瞭含笑而終。
2、神魔之井通道被薑世離以伏羲劍之力強行打開，使得人魔兩界可以自由來往。這對於人界的影響顯然很大，因為魔界中人往往都有各種高深的法術，兩界的戰鬥力不平衡導致人界有可能會被入侵。太武決定沉下蜀山本體來阻擋神魔之井封印，並結下法陣徹底對兩界通道進行封印。封印需要持續千年才能穩固，而穩固後，任何空間法術也都不再能夠自由來往兩界，這樣人界才能得到真正的安寧。薑雲凡答應太武的請求，幫忙進行兩界封印。而多年後，從他胸前佩戴的血玉中傳來瞭一聲熟悉的呼喚，仙劍5結局就這麼告終瞭。
3、唐雨柔到底死瞭沒死，最後的呼喚是她自己喊的嗎，這個問題首先得瞭解唐雨柔以及血玉的作用機制。20年前唐雨柔還是襁褓時，因為被關在覆天頂地牢缺水導致生命垂危，草谷說回天乏術，隻能借助血玉碎片的力量為其延壽大致20年。原本計劃是20年後血玉本體中的薑世離元神被凈化，然後就可以用完整的血玉徹底救活唐雨柔。結果薑世離脫出血玉封印導致血玉力量喪失，隻能通過時間的積累而逐漸恢復力量。
4、在執行逆天陣的時候，唐雨柔並沒有死，而是進入血玉核心沉睡，因為她所具有的血玉碎片的力量已經不足以支持她繼續存活瞭。盡管之後血玉力量喪失，但經過瞭數十年，血玉也在逐漸恢復力量，使得唐雨柔得以蘇醒。那麼最終唐雨柔必然也會從血玉中光彩重生，這和草谷的說法也是一致的。草谷在大戰結束後詢問薑雲凡，若是有朝一日唐雨柔能夠回來，你會等她嗎？薑雲凡也肯定的表示會等。而結局中唐雨柔的呼喊，自然就是她蘇醒也就是血玉力量開始恢復的征兆。
5、龍幽表明身份稱自己是夜叉皇子，但魔翳率領的夜叉軍仍然不肯聽從龍幽號令。這個問題的原因主要是兩點。第一是魔翳本人治國有方統軍有術，手下兵將當然不會輕易倒戈。從祭都的狀態就可以看出，魔翳對於軍隊的紀律要求還是比較嚴明的。薑雲凡等人擅闖九黎祠被發現，魔翳一聲令下則所有兵將都齊齊退下，可想而知這個人的號召力。而且在魔界大旱的情況下，魔翳統治的夜叉族仍然沒有陷入混亂，也說明魔翳本人的確是有非常過人的才能，所以唐雨柔才會對魔翳感到好奇從而想要見他一面。第二點，就是夜叉臣民都知道，魔翳並不是個專權獨斷的統治者，他心裡隻有夜叉族，而並不是想讓自己當夜叉王。魔翳做的一切，歸根究底都是希望解決魔界水源問題，讓他們有水喝，不再過那種幹旱的苦日子。無論是軍隊還是平民，他們都認為魔翳做的是對的，魔翳是為瞭他們自己好，所以即使龍幽表明身份，夜叉軍自然也不願意輕易退下，還是唯魔翳馬首是瞻。
6、魔翳臨死前，仍然心心念念的說“夜叉吾族、夜叉吾族”也再次確認瞭對他而言，族民的利益高於一切。魔翳死後，龍幽就是夜叉唯一的統領者，可以註意到的細節是，龍幽在承諾必將解決魔界大旱的問題後，夜叉軍才真正聽令決定退入神魔之井。
7、兩界封印結成以後，真的無人再能夠穿梭兩界瞭嗎，這個問題在遊戲中並無交代，但是想想前作中的大佬，一般來說熟悉仙劍世界觀的玩傢都會認為憑借蜀山派這麼一個區區人界修仙門派的封印之術，根本不可能完全封印人魔兩界。看看仙劍3就知道瞭，如果兩界之間的通道真的能夠被一個封印所阻隔，那麼重樓和飛蓬也沒必要各自鎮守在神魔兩界對應的神魔之井入口瞭。要論封印力量，神魔的封印術怎麼著也要比蜀山派高明得多吧。所以大致可以判斷出，這些封印術或許很強大，但不可能100%攔住所有人，比如重樓這種能夠自由穿梭六界的大佬肯定不會把一個封印術放在眼裡的。
