1、蟲害：造成水稻穗枯死的蟲害主要有螟蟲（三化螟、二化螟、大螟）、褐稻飛虱、螻蛄等，其中螟蟲以二化螟為主，以幼蟲蛀食莖稈造成白穗，拔起白穗可見斷口處有明顯蟲咬痕跡。褐稻飛虱以成、若蟲聚集水稻基部刺吸汁液為害，嚴重時造成植株基部組織破壞、腐爛，同時誘發基腐病、菌核病，常造成田間水稻局部或連片枯死。螻蛄為害主要集中於田埂邊，咬斷近地表莖稈，造成整棵枯死。
2、藥害：主要是由藥劑使用不當造成的。一是用藥濃度過大造成局部植株嚴重灼傷死穗；二是誤用除草劑造成植株連片整株枯死。
3、病害：造成水稻穗枯死的主要病害有穗頸瘟、節瘟、惡苗病、細菌性基腐病、小球菌核病、紋枯病等，其中穗頸瘟在水稻抽穗期侵染危害，致使穗頸褐變壞死形成白穗，危害枝梗可造成稻穗局部枯死。
以上就是水稻穗枯死的主要原因瞭，除此之外，還有導致水稻穗枯死的間接原因，比如品種缺陷、肥料失衡、水管不當等。
