1、堆藏
堆藏是把選好的南瓜直接堆放在室內。堆放前地面先鋪一層幹草或麥秸，上面堆放南瓜。擺放的方向和生長時的狀態相同，可將瓜蒂朝裡，瓜頂朝外，依次堆碼成圓堆，每堆15-25個，高度5-6個瓜高為好。同時留出通道，以便檢查。
2、窖藏
窖藏的南瓜宜選用主蔓上第二個瓜，根瓜不宜作貯藏用。生育期間最好不使瓜直接著地，並要防止陽光暴曬。采收時謹防機械損傷，特別要禁止滾動、拋擲，否則內瓤震動受傷易導致腐爛。南瓜采收後宜在24℃-27℃下放置2周，使瓜皮硬化有利於貯藏，這對成熟度較差的瓜尤為重要。
3、架藏
架藏的倉位選擇、質量挑選、降溫、防寒和通風等要求與堆藏相同。所不同的是倉庫內用木、竹或角鐵搭成分層貯藏架，鋪上草包，將瓜堆放在架上。或用板條箱墊一層麥秸作為容器。瓜放入後碼成垛進行貯藏。這種方法透風散熱效果比堆藏好，倉位容量也比堆藏大，觀測、檢查比較方便。
