1、招生的區別。公辦學校招生是由各當地教委抽取建檔線以上，直接進入高等院校學習深造，而民辦院校則是在高考生進入高考期後，由本校派人直接到各地招收學員，各個學校由於各自的差異，因此在招生時選拔學生的方法也不同。
2、學校管理上的區別。民辦院校相對於公辦院校來說知名度美譽度要更重要一些，因為學院的生存是取決於在校生的多少。生源的數量和質量決定瞭學院的發展，為瞭保證充足的生源民辦院校的管理會更加的嚴格一些。在大學這種寬松的氛圍下更利於學生真正放下心來進行學習，為未來而奠定基礎。而公辦院校管理則不同，他們可以不去顧及在校生的多少，因為他們吃的是國傢的口糧。
3、辦學信譽上的區別。現在國傢鼓勵民辦院校，從政策、財政和學院榮譽獲得上也給與一定的幫助，尤其是最近國務院會議中央領導提出大力發展和支持民辦教育，民辦院校的生存空間雖說是在不斷地增加。但是相比較公辦的就遠遠不及瞭，為瞭博取更大的生存空間，民辦院校必須有一個好的信譽保證。並且誠信辦學的觀念貫徹的更加深入。學院的規范度也更加的好。
4、能力培養上的區別。在國傢鼓勵大學生自主創業的大環境下，上大學已經不像以前一樣隻是為瞭那一紙文憑，更多的是希望自己的能力得到加強。而公辦院校的教育重點在於文化教學，對素質能力的培養稍差一點，而民辦恰恰相反因為沒有強勢後盾所以民辦院校在註重文化教育的基礎上更加強瞭社會能力的鍛煉。對各類社團學生會的管理更加嚴格一些。學生得到的鍛煉從而更多一些。
5、辦學的性質不同。民辦院校和公辦院校的根本區別就是辦學的性質不同。隻不過國辦院校是國傢集資方面以國傢為後盾，但是公辦高校和民辦高校辦學的目的都是為祖國的社會主義事業培養可用的人才。
