1、鮮海蜇的刺絲囊內含有毒液，買回來的新鮮海蜇一般要用食鹽、明礬經過3次加工、醃制，濾去水分後才能去除毒素。加工完畢，在海蜇食用前還要經過反復浸泡、漂洗，脫去食鹽、明礬，清洗完後還需將海蜇用食醋浸10分鐘以上，因為富在海蜇表面的副溶血性弧菌對酸最敏感，這樣就可以殺死附在海蜇上的副溶血性弧菌，這樣之後食用起來較為安全。
2、新鮮的海蜇中含有含有五羥色胺、四氨絡物及多肽類等物質，可能引起過敏等組胺反應，同時海蜇屬於海鮮，含有一定的寄生蟲和細菌，它的表面附著副溶血性弧菌，如果直接吃新鮮的海蜇，可能引起腹痛、腹瀉、惡心嘔吐甚至休克等食物中毒癥狀。孕婦直接食用鮮海蜇，還可能導致胎兒畸形，不利於胎兒的健康發展。
