1、冷藏：龍眼懼怕高溫，一旦溫度較高的情況下，不僅容易腐爛，還易發芽，因此買到的龍眼最好是放在冰箱冷藏室保存，一般分批用保鮮袋裝好的情況下，可存放一個星期左右，但不宜放久，否則會影響龍眼的口感和果肉質感。
2、冷凍：如果大量保存龍眼，建議用速凍保鮮的方法，將完好的鮮龍眼，直接放入保鮮袋中，然後放在冰箱冷凍層，長期貯藏於零下18℃的環境中，可貯藏6個月—1年或更長的時間新鮮可食不會發芽，不過再次吃龍眼不建議鮮食，可燉湯或做甜品加熱食用更好。
3、曬幹：龍眼幹又叫桂圓幹，將新鮮龍眼果實直接曬幹，或剝殼取其肉曬幹都可以，這樣的做法不僅防腐防發芽，延長保存時間，還更加甘甜美味，也是常見的保存龍眼方法。
