1、酶作用：
純牛奶由於沒有經過加熱、酶鈍化等手段處理，在牛奶中還含有一定量的酶類，盡管它們的數量很少，但在存放過程中也會慢慢使牛奶中蛋白質變性，出現結塊現象。
2、低溫：
蛋白質在高溫、低溫、酸性以及堿性等各個環境中都會出現蛋白質變性，很多人為瞭保存牛奶，將純牛奶放在冰箱中保鮮，但也有部分放在冰凍層中，這種低溫也會引起純牛奶結塊。
3、變質：
所有的牛奶都含有豐富的營養成分和水分，是完美的菌類培養基，並且也存在一定的保質期，在存放過程中若是被污染，很容易出現牛奶變質，結塊、變酸、變色等都是牛奶變質的標志。
