1、實生木瓜苗。實生木瓜苗優點就是它是非常純正的，而且種植的時候它的優良品質更能很好的保存，唯一的缺點就是出苗不一致。但我們在選購實生的木瓜苗的時候我們通常首先觀察就是木瓜苗的根系是否發達，其次就是看木瓜苗的水分是否正常，有沒有缺水。最後就是看木瓜苗的新葉是否旺盛，並且查看是否有被蟲害、病害損害以及外表傷害的痕跡。如果一切都比較完好那就是比較優質的樹苗。
2、嫁接木瓜苗。嫁接的木瓜苗它主要的一個特點就是它的生長速度比較快，生長周期比實生苗的要短，進入花期要快，自然結果早。那麼我們選購嫁接苗的時候最重要的一點就是觀察鉆木和接穗處的吻合情況，是否有被損害的現象買或者是沒有愈合完成以及愈合後被損害進行多次嫁接的痕跡。如果沒有的話那就繼續觀察，看嫁接苗新枝的生長情況，有沒有出現營養不良的現象。最後就是觀察嫁接原木的根系情況，是否能保證木瓜新苗的正常生長，如果一起都可以的話，那就是比較符合標準的嫁接苗瞭。
3、扦插木瓜苗。通過扦插繁殖的木瓜苗其實也是非常不錯的，而且它既繼承瞭原有木瓜品種的優良特點，又加快瞭苗木生長的速度，能盡快的進入結果期。那麼我們在挑選扦插苗木的時候，其實並沒有太多需要註意的地方，它的挑選方法基本上和實生苗的一致。先觀察苗木的根系生長情況，而後看樹體的生長狀態，選出最佳的幼苗。
4、註意事項。在挑選木瓜苗的時候，我們還有一點需要註意，那就是苗木的高度和直徑都不宜過大，同時也不宜過小。最好的苗木高度是二十到三十厘米高左右。還有就是現在市場上劣質的苗木非常的多，如果真的想要買到優良的品種以及優質的苗木，最好還是去正規的育苗基地進行購買。
其實木瓜苗的挑選方法和其他苗木的挑選方法都差不多，首先就是要挑選優良的品種、適合當地栽種的木瓜，其次就是挑選成活率高的苗木，選出壯苗、健苗。
