1、乾隆皇帝（張鐵林飾）東巡時與女子夏雨荷（林心如飾）有一段露水姻緣，並生下一個女兒夏紫薇（林心如飾）。多年後，夏雨荷病逝。紫薇偕丫環金鎖（范冰冰飾）帶著當年乾隆留下的信物，從濟南千裡迢迢到北京城去與失散多年的父親相識。主仆兩人到京城後根本無法進宮面聖，在走投無路之際遇上瞭女飛賊小燕子（趙薇飾），並結為好友。小燕子熱心為她想辦法混入宮，但在陰差陽錯中與紫薇互換瞭身份，成為清宮中的“還珠格格”，而紫薇卻落得一無所有，連唯一的證物都失去瞭。皇上為慶賀重獲愛女舉行祭天酬神的儀式，儀仗隊伍行經市街，正巧被紫薇、金鎖看到。激動之餘紫薇昏倒在地，被大學士福倫（海波飾）之子福爾康（周傑飾）所救。福府在知道其身世後將她收留。
2、小燕子將紫薇弄進宮做貼身丫頭，但兩人情同姊妹的感情漸漸讓周圍的人產生懷疑。而皇上對紫薇也有說不出的親切感，卻引起瞭皇後的妒意。在容嬤嬤（李明啟飾）的慫恿下，皇後竟派人將紫薇抓進寢宮內嚴刑拷打，又將她關進密室。小燕子發現紫薇失蹤後心急如焚，爾康等夜探慈寧宮，終於找到瞭奄奄一息的紫薇。次日，小燕子再請乾隆出馬對付皇後，總算將紫薇救出，化險為夷。乾隆南巡下江南爾康紫薇永琪小燕子等一並同行。期間，經歷過采荷一事後，永燕終於表情。而之後的廟會上，有人行刺乾隆，紫薇擋下瞭一刀，也是極其致命的。爾康看著乾隆望向紫薇的眼神表情，醋意大發。後來回京，乾隆大賞小燕子紫薇。藏王偕公主塞婭（張恒飾）前來紫禁城欲向大清示威，派出武士數十人與大清武將比武，不想被爾康打得七零八落。乾隆龍心大悅。藏王為爭回面子提議合婚，乾隆為穩定番邦同意將塞婭公主指婚予福爾康，福爾康與皇上據理力爭，終於紙包不住火將紫薇的身世說出，至此紫薇身份大白，小燕子難逃欺君之罪。小燕子以其口才和皇上力爭，加上紫薇願與小燕子同生共死，皇上終於軟化，紫薇、爾康、小燕子、永琪這兩對有情人終成眷屬。
