心肌炎很容易發生誤診，臨床上最常與之發生混淆的疾病是急性冠脈綜合征。從臨床癥狀看，兩者都以胸痛表現為主，可伴有心悸、乏力、胸悶或呼吸困難，兩者發病時都可以引起心電圖st-t改變。同時化驗血中，心肌酶或心肌壞死標志物都可出現不同程度的升高，因此在疾病早期兩者常常難以鑒別。急性冠脈綜合征多以老年患者為主，常常有高血壓、糖尿病、高脂血癥等危險因素，而心肌炎更多見於青少年，發病前可以有前驅上呼吸道感染癥狀。隨著病情的發展，急性冠脈綜合征心電圖常常出現動態改變，而心肌炎的改變則缺乏這種典型的特征。因此仔細觀察病情變化，可以將二者進行鑒別。
