出現Ⅱ型呼吸功能衰竭的病人除瞭缺氧以外，氧分壓低於正常水平，二氧化碳分壓高於正常水平，說明病人不但不能把外界的氧氣充分吸入到肺泡裡，同時機器裡產生的二氧化碳也不能正常排出。一般指氧分壓低於60mmHg，二氧化碳分壓高於45mmHg，兩者同時存在時，稱為Ⅱ型呼衰。Ⅱ型呼衰的原因由於肺通氣功能不足導致，往往見於重度感染或者慢阻肺急性加重時會引起Ⅱ型呼衰。其治療原則是要進行對因治療，針對疾病本身的原因進行治療。進行氧療時不能吸入更多的氧，要吸入低濃度即小於30%的氧。同時，應用呼吸興奮劑，甚至用機械通氣來改善病人通氣，提高病人潮氣量，改善Ⅱ型呼衰患者本身癥狀。Ⅱ型呼衰治療原則的方法和Ⅰ型呼衰不一樣，Ⅰ型呼衰單純吸氧就可以，可以吸入高濃度的氧，Ⅱ型呼衰要吸入低濃度氧，同時改善通氣治療。一般Ⅱ型呼衰患者在慢性氣道疾病中比Ⅰ型呼衰更常見，Ⅰ型呼衰主要見於急性間質性肺炎或肺間質纖維化進行性加速時更常見。對於治療難度，隻要進行對因治療，快速癥狀緩解，治療什麼都不是十分困難。
