膽結石的成因非常復雜，近幾百年來醫學界一直在研究膽結石的成因，可是時到今日對膽結石的成因仍然瞭解的非常少。通俗的來講膽結石的成因取決於這幾點。第一個，就是膽汁裡邊膽固醇成分的比例，膽汁酸鹽成分的比例以及卵磷脂成分的比例。當這些成分比例之間發生失衡，就容易形成膽結石。如果從流行病學的角度上來講，膽結石往往是見於高脂飲食的人群，比如體型略微肥胖，脂類飲食比較多，這些人群容易發生膽結石。另外膽結石的發生還可能有一些傢族性的因素，比如父母兄妹得瞭膽結石，有的時候也是膽結石高發的一類人群。另外跟居住環境、飲食習慣等等都有一些關系。
