抗菌藥物治療性應用的基本原則，包括以下幾點：第一、根據適應癥用藥：首先要判斷是否是細菌感染，如果確定細菌感染或者可疑的細菌感染，才能夠應用抗菌藥物治療。第二、有針對性的選擇用藥：抗菌藥物的選擇要結合感染的部位，另外還要結合是社區獲得性感染，還是院內獲得性感染。要初步判斷是敏感的細菌感染，還是耐藥的細菌感染，有針對性的選擇抗菌藥物來治療。第三、根據藥敏結果用藥：如果患者感染的病情偏重，或者比較復雜，應盡可能進行細菌的培養，可以采用血培養、痰培養、尿液培養、糞便培養，或者可以進行體液培養，比如腹水、胸水等體液的培養，然後根據藥敏的結果，選用敏感的抗菌藥物治療。第四、避免過度使用抗菌藥物：一方面，如果能單藥治療的不選擇聯合治療，另一方面，一旦恢復之後要盡早停藥，避免過長時間的應用抗菌藥物。第五、逐級用藥：如果簡單、低級別的抗菌藥物能夠控制感染，不能夠過度選擇更高級別的抗菌藥物來治療。第六、避免二重感染：對於長期應用抗菌藥物治療的患者，要註意避免二重感染的問題。
