龜頭尖銳濕疣治療和其他部位的尖銳濕疣沒有本質的區別，濕疣首先要通過一定的方法，包括手術、藥物或者物理治療的手段，比如激光、微波、冷凍、電灼等等，把疣體去掉，這是重要的第一步。其次，濕疣是容易復發的，龜頭的尖銳濕疣也是容易復發的，要防止它的復發，如果再復發需要再次處理，把疣體去掉，可以抹一些比如咪喹莫特一類的藥膏或者是幹擾素來減少它的復發。最理想的狀態是把濕疣疣體去掉並且阻止它復發以後，還要清除病毒，HPV病毒相對來說清除起來比較難，可以通過一些其他的手段，比如比較長時間的抹些藥或者是用光動力的治療方法以及一些其他的輔助手段，比如中藥的泡、洗等等，來防止復發和盡量的抑制和清除HPV病毒。
