肝囊腫既不影響肝功能，也不會發展成肝癌，所以囊腫通常不需要理它，隻要定期復查就可以，如果特別大，讓患者感到不舒服或者有意願一定要治療，先確定如果直徑大約三厘米以上的，可以在超聲引導下穿刺抽液；但是如果抽完以後，部分患者還有可能還會再生的；如果是多囊肝，肝的腫大壓迫腹部，同時影響瞭呼吸循環，這個時候是需要手術減壓的，考慮肝的切除術，囊腫的切除術，囊腫內的引流術，囊腫的穿刺抽液及硬化術等多種方法。多囊肝除非手術病變於肝的一葉，伴有癥狀，或者考慮可能有惡變的情況，一般都不太主張用手術治療，定期復查就可以，因為多囊肝惡變的幾率特別小，而且反復的進行抽液，患者後期囊腫還是大多數人可能還是要重新再長的。
