早上起來頭疼是主觀感覺癥狀，原因很多，既有生理性因素，也有各種疾病導致的，需要結合具體的情況進行具體分析。如果睡覺是在封閉的睡眠環境，空氣不流通，同室一起睡覺的人比較多，可以造成室內二氧化碳蓄積，變成人體的麻醉劑，使人睡眠時間延長，醒後就會感到頭昏昏沉沉、頭疼，這種情況換個通風的環境睡覺就可以好轉，這是生理反應。某些患有睡眠相關疾病的患者睡多瞭，早上起來就會出現頭疼，如睡眠呼吸暫停綜合征患者，由於睡眠中間斷出現呼吸暫停，可以導致間斷的血氧降低，損傷神經細胞，從而出現白天醒來時頭疼等癥狀。此外，還有各種原因不明的原發性頭痛，部分患者是與睡眠有關。
