大部分頜骨囊腫沒有明顯的臨床癥狀，頜骨囊腫如果發生繼發感染，患者會覺得局部的腫脹、疼痛等情況。很多頜骨囊腫是患者治療牙齒的時候拍片不經意發現的。頜骨囊腫如果體積比較大的時候可以引起相應部位的腫脹，患者才會發現，臨床的檢查可以見到頜骨膨脹比較明顯，去按壓病變部位，可以感覺到頜骨，就是囊腔囊壁變薄以後，可以有稱為乒乓球樣的壓彈感。如果頜骨囊腫沒有及時治療，有時候會繼發感染，病人局部會發生紅腫、疼痛，另外相應部位的牙齒可以有移位，甚至有部分的情況下還可以發生牙根的吸收，這些都是頜骨囊腫常見的一些臨床癥狀。
