引起先天性腎積水的原因非常多,大多數情況下都是生理性的,有超過一半的孩子,先天性腎積水是不需要治療的,是孩子發育的過程。隨著孩子生長發育,它會自愈。有的孩子是病理性的,臨床上比較多見的是梗阻因素。不同部位的梗阻都可能會產生先天性的腎積水。從腎臟一直到尿道口,包括包皮的開口,任何地方有原因造成排尿的困難,都會引起腎積水。越是靠近腎臟,引起腎積水的可能性越大。這些梗阻的原因包括尿路腔道裡面的狹窄、梗阻,也包括比如血管的壓迫、周圍腸管的壓迫,甚至腫瘤的壓迫,對尿路引起的外界的壓迫,也會引起腎積水的出現。