慢阻肺患者如果沒有經過治療，任其持續進展，就會使慢阻肺持續加重，越來越重。低氧會引起肺動脈高壓，引起肺心病。同時，在慢阻肺的惡化過程中，會出現因感染誘發的急性呼吸功能衰竭。慢阻肺如果是自然病程，沒有經過幹預，病死原因基本上是由於感染引起的呼吸功能衰竭，最後導致病人死亡。有時也會因為感染誘發的肺動脈高壓，或者肺心病急性加重引起急性的右心功能衰竭，導致病人死亡。也可能是呼衰和心衰，都有會導致病人死亡，甚至在慢阻肺的呼吸功能衰竭過程中，還會出現肺動脈栓塞，引起的病人死亡。因此，慢阻肺病人如果不治療，最終死因經常都是由於感染誘發的心肺功能衰竭或者心臟、肺血管的合並癥導致死亡，是常見的原因。少見的原因還有由於心律失常，甚至其他肺性腦病引起的神經功能變化，直接導致死亡。
