膀胱灌註的藥物，常用的有化療藥物以及免疫治療的藥物，常用的化療灌註藥物有吡柔比星、表柔比星、多柔比星、羥基喜樹堿、絲裂黴素、吉西他濱等等，而膀胱灌註免疫治療的藥物主要是卡介苗。膀胱電切術以後，即刻膀胱灌註化療能夠顯著降低非肌層浸潤性膀胱癌的復發率，其原理是術後即刻灌註化療，能夠殺滅手術當中播散的腫瘤細胞以及創面殘留的腫瘤細胞。為瞭預防細胞種植，應該在術後24h以內盡早完成膀胱灌註化療，而利用卡介苗進行膀胱灌註，免疫治療腫瘤，確切的作用機制尚不清楚。目前認為卡介苗對膀胱癌的治療作用，是通過直接殺傷腫瘤細胞或者誘導體內非特異性免疫反應，引起Th1細胞介導的免疫應答，從而間接發揮抗腫瘤作用。
