新冠肺炎的檢測，采取上呼吸道和下呼吸道的標本進行檢測。目前常用的檢測方法是取咽拭子或鼻拭子，進行冠狀病毒的核酸檢測。因為咽拭子方便、簡單、易行，用於大量人群的排查。核酸檢測還可以根據患者的不同情況，取痰液、支氣管肺泡灌洗液進行檢測，目前認為核酸檢測相對準確。對於鼻咽拭子新冠病毒檢測陰性者，又有癥狀和流行病接觸史者，還可以進行新型冠狀病毒特異性抗體IgM和IgG的血清學檢測，以提高診斷率。然而在發病初期的一周內，IgM和IgG的陽性率不高，同時由於一些疾病等因素可以出現假陽性，因此不能單獨作為診斷依據。另外對於高度懷疑的患者，還可以進行肺部CT的檢查。
