不同的乳腺炎，病因也是不一致的。對於哺乳期的乳腺炎，往往是由於乳汁淤積，加之細菌逆行感染，從而得的哺乳期乳腺炎。而對於非哺乳期乳腺炎，現在常見的主要包括漿細胞性乳腺炎和肉芽腫性乳腺炎兩大類。漿細胞性乳腺炎是由於乳頭的先天的畸形，導致乳腺導管內的分泌物不能夠正常的排出體外，在導管內堆積形成化學性的炎癥，刺激瞭乳腺導管管壁，從而引起化學性、化膿性、炎癥性的疾病。對於肉芽腫性乳腺炎，目前的發病的機制尚未明確，部分專傢認為由於體內有殘餘的乳汁，而當患者的自身免疫發生異常的時候，這種乳汁被當作異物從而發生的炎癥性疾病，也就是屬於一種自身免疫性的疾病。因此不同的乳腺炎發病的機制是不一樣的，從而治療方案也是不同的。
