上尿路感染最常用的是靜脈點滴抗生素治療，有利於快速控制感染，比如氟喹諾酮類藥物中的左氧氟沙星、環丙沙星、莫西沙星等等，或者使用氨基糖甙類，比如依替米星，頭孢菌素類，比如頭孢噻肟、頭孢曲松，以及大環內酯類，比如阿奇黴素，都屬於廣譜抗生素。靜脈點滴抗生素治療的同時進行細菌培養，包括血培養和尿培養，而後根據血培養、尿培養細菌的結果，以及藥物敏感性試驗及時調整為窄譜抗生素，大多數人5-7天癥狀能夠平穩下來，而後改為口服抗生素進行治療，口服藥常用的有左氧氟沙星、環丙沙星、洛美沙星、阿奇黴素、頭孢地尼、頭孢克肟、磷黴素等等，通常建議治療的療程至少2-4周。
