瘧疾用什麼藥是遵循安全、有效、合理、規范的原則，根據瘧原蟲種及其對抗瘧藥的敏感性和患者的臨床癥狀、體征來選擇的，具體介紹如下：一、用於間日瘧和卵形瘧的藥物，首選磷酸氯喹加磷酸伯氨喹，磷酸氯喹無效時可選用磷酸哌喹或磷酸咯萘啶或者ACT加磷酸伯氨喹。二、治療三日瘧首選磷酸氯喹，無效時可選用磷酸哌喹或者磷酸咯萘啶、ACT。三、治療惡性瘧或者是惡性瘧與三日瘧混合感染時，選用ACT或磷酸咯萘啶。四、妊娠3個月內的孕婦選用磷酸哌喹。五、治療重癥瘧疾時使用青蒿素類註射液，或磷酸咯萘啶註射液。六、治療惡性瘧與間日瘧混合感染、惡性瘧與卵形瘧混合感染，選用ACT或磷酸咯萘啶加磷酸伯氨喹。七、預防用藥使用磷酸氯喹或磷酸哌喹。八、休止期根治藥使用磷酸伯氨喹。藥物的劑量、療程和給藥途徑需要由專業的醫生來掌握以保證治療和預防效果，並延緩抗藥性的產生，ACT指的是以青蒿類藥物為基礎的復方藥物。
