通過自身免疫力,一般不能徹底清除皰疹病毒,但可以控制病毒的感染。皰疹病毒感染之後,一般病情完全緩解後病毒會潛伏在體內,比如EB病毒、巨細胞病毒會長期潛伏在淋巴細胞內,而單純皰疹病毒、水痘病毒感染之後在臨床痊愈,會潛伏在神經節內。這類長期潛伏的病毒將來免疫功能低下時還可以被激活而引起感染,出現這類的病毒感染後,在治療方面,可以通過自身的免疫力來控制病情,達到臨床痊愈。有些病毒的感染,如果病情比較重時,也需要應用抗病毒藥物治療,比如針對單純皰疹病毒1型或2型,常用的藥物是阿昔洛韋,而針對水痘的病毒,一般也可以應用阿昔洛韋來治療。另外,針對EB病毒和巨細胞病毒,一般可以選擇更昔洛韋來治療。EB病毒使用更昔洛韋的治療效果不好時,還會選擇幹擾素治療。而針對皰疹病毒的6型、7型、8型,一般也可以選擇阿昔洛韋、更昔洛韋來治療。但無論是哪種皰疹病毒感染,即使用藥治療都不能夠從體內將其徹底清除。即使臨床痊愈後,病毒也會潛伏在體內,將來免疫功能低下時有可能再次被激活而引起感染。