1、科屬不同：菊花腦是菊目菊科菊花族菊屬草本植物；野菊花是菊目菊科管狀花亞科春黃菊屬族菊屬多年生蔡奔植物。
2、外形不同：菊花腦株高100cm左右，莖稈纖細，有很多分枝，且分枝性極強，長得葉子是單葉互生，呈綠色長卵型，邊緣有粗大的復鋸齒。開的花呈黃色舌狀或管狀，結的果子為瘦果，且裡面含有千粒細小的種子。野菊花株高25～100cm左右，莖直立或鋪散，上面長有很多分枝，開的花呈棕黃色舍狀，類球形，總苞有4～5層苞片，外層的苞片呈卵形或卵狀三角形，頂端呈圓形或鈍形。
3、花期不同：菊花腦花期在9～11月，野菊花花期在6～11月。
4、用法不同：菊花腦可以用來炒菜、涼拌、燉湯吃，還可用來當花卉裝扮室內環境；野菊花可以用來做藥材。
5、功效不同：菊花腦具有清熱解毒、降血壓、開胃的效果；野菊花具有散瘀、明目、散熱、清熱解毒的效果，可用於治療感冒、肝炎、高血壓、痢疾等疾病。
菊花腦可以用來泡茶喝，但建議用來做菜吃或燉湯吃最好，因為菊花腦的嫩莖葉有股菊花清香味，內含豐富的蛋白質、脂肪、維生素、纖維素等功效。
