1、換水清藻。水藻的繁殖和水產養殖的水有很大的關系，水藻的主要生長就是靠水裡面的微生物來生長繁殖，所以控水是一個很關鍵的地方。最簡單有效的控水方式就是定期換水，然後在換水時對池塘的藻類進行清理，從根本上面斷絕其繁殖擴大的情況，不過每次換水比較麻煩，如果池塘過大過多的不建議用這個方式進行。
2、防治水肥。大傢都知道當養殖池裡面的藻類繁衍的十分茂盛的時候，就說明這個水池裡面的水比較肥沃瞭，養分充足，那麼底部的海藻在這麼優質的環境下，生長自然會及其旺盛。而日常飼料的冗餘堆積，是主要導致水體發肥的原因之一，這些飼料在水中分解後產生的養分魚沒法吃到，最後就會慢慢乘積到水底變成藻類的養分。所以日常喂養的要控制量，延長一點喂養時間，減少飼料的浪費，然後定期清理池底積累的物質，這樣能明顯的防控水肥，抑制藻類生長。
3、喂養食藻物。藻類其實也是可以用生物除藻的方式的，一般是喂養一些吃藻的魚類，這個也是比較常見的一種手段。比較常見的吃藻的魚有鰱魚、鳙魚等，這些算是吃水藻比較厲害的品種，且日食用量較大，在很多地方都有人用這個方式。不過選擇這樣的魚類的時候一定要註意這些是否能和自己的主養品種混養，事先做好調查，以免自己遭受不必要的品種。其次要試驗下他們是否吃這個水藻，再規模的投放。
