1、企業根據《認定辦法》和《工作指引》進行自我評價，初步判斷是否達到認定條件的要求。
2、企業通過網絡系統提交至認定機構。認定機構核對企業註冊信息，在網絡系統上確認激活後，企業可以開展後續申報工作。
3、企業登錄高新技術企業認定管理工作網，按要求填寫《高新技術企業認定申請書》，通過網絡系統提交至認定機構，並向認定機構提交國傢高新技術企業認定材料。
4、認定機構收到企業申報材料後，從專傢庫中抽取至少5名評審專傢(其中技術專傢不少於60%，並至少有1名財務專傢)組成專傢組。進行審查。
5、認定機構根據專傢組評審意見，對申請企業申報材料進行綜合評審（可視情況對部分企業進行實地核查），提出認定企業名單，報領導小組備案，報送時間不得晚於每年11月底。
6、經認定報備的企業名單，由領導小組辦公室在高新技術企業認定管理工作網公示10個工作日。有異議的，須以書面形式實名向領導小組辦公室提出，由認定機構核實處理；領導小組辦公室可對報備企業進行隨機抽查，對存在問題的企業交由認定機構核實情況，提出處理建議。
