1、水中保存，在睡蓮根冬季保存中，可以在冬季來臨前把睡蓮根挖出，然後用水清洗掉根系上的淤泥;放在淡水中浸泡，水位剛好淹沒住睡蓮根，並在上面蓋上一層薄膜，睡蓮根在水中能保存兩個月左右。
2、冷凍保存，修剪好睡蓮根，放在透氣的容器中，並放置在冰箱中冷藏，冷藏的溫度設置成5℃，並且周圍的濕度要控制在60%以上;冷凍睡蓮根能保存100天左右，等入春後再拿出來栽種到泥土中即可。
3、通風保存，把睡蓮根從淤泥中挖出，不要用水洗掉淤泥，用幹凈的紗佈包裹起來，放在透氣透風的地方保存;不需要用水將睡蓮根表面打濕，適當的剪掉長出的嫩芽，這種方法可以保存至春季來臨。
4、真空保存，選擇最粗壯的睡蓮根，然後放入盒子中密封起來，用工具將盒子中的空氣全部吸出，睡蓮根會懸浮在空中，直至需要種植的時候再拿出即可;睡蓮根不會在真空中腐爛，並保存時間非常久。
