1、參保人群不同。學生醫保主要針對在校大學生、在校大中專、中小學生、幼兒;而農村合作醫療是面向全體農民的。
2、參保費用。中小學生基本醫療保險費由個人繳納和政府補助兩部分組成。籌資標準為每人每年230元，其中政府補助200元，個人繳納30元;對於低保傢庭和重度殘疾學生個人繳費由政府全額補助。而新農合各級財政對新農合和居民醫保人均補助320元。其中中央財政補助標準120元，農民和城鎮居民個人繳費每人每年90元左右。
3、報銷方式。學生醫保保險公司在結案後，會把賠付金轉到學校賬上，計財處便在校收發室旁宣傳欄內發佈通知，見通知後學生應及時帶身份證(學生證)到計財處領取保險金。新農合參保者出院後，將經患者本人簽字或蓋章的住院發票、出院記錄、費用清單、轉診證明及本人身份證復印件或戶籍證明繳本鄉鎮合管所，經審核後集中統一送交市農保業務管理中心進行報銷。
以上就是學生醫保和農村合作醫療的區別，相信大傢看完之後對學生醫保和農村合作醫療有不同的認識。需要註意的是，學生醫保有一些地方還是針對性的實行本地政策，也就是除本地以外的學生不可以通過學校的途徑來購買學生醫保，這是很多學生都不能享受這個政策。
