1、工作原理不同：磁浮列車是利用電磁力讓車體懸浮在軌道之上，並通過電磁力推動車輛運行的交通工具。高速鐵路是采用輪軌系統的交通工具，修建客運專線，在上面跑動車組。
2、行駛速度不同：磁浮列車最大的特點是在運行過程中不存在輪軌系統所無法消除的摩擦阻力，隻剩下空氣阻力，運行速度可以超過400km/h，甚至可以達到600km/h。高鐵的運營速度最高為481.2km/h，試驗速度是574.8km/h。
3、工程造價不同：上海磁懸浮專線全長29.863公裡，造價89億人民幣，單價2.98億/公裡。高鐵造價大約為1.3億/公裡。
