1、消化系統的基本生理功能是攝取、轉運、消化食物和吸收營養、排泄廢物，這些生理的完成有利於整個胃腸道協調的生理活動。食物的消化和吸收，供機體所需的物質和能量，食物中的營養物質除維生素、水和無機鹽可以被直接吸收利用外，蛋白質、脂肪和糖類等物質均不能被機體直接吸收利用，需在消化管內被分解為結構簡單的小分子物質，才能被吸收利用。
2、食物在消化管內被分解成結構簡單、可被吸收的小分子物質的過程就稱為消化。這種小分子物質透過消化管黏膜上皮細胞進入血液和淋巴液的過程就是吸收。對於未被吸收的殘渣部分，消化道則通過大腸以糞便形式排出體外。
3、消化過程包括物理性（機械性）消化和化學性消化兩種功能。就對食物進行化學分解而言，由消化腺所分泌的各種消化液，將復雜的各種營養物質分解為腸壁可以吸收的簡單的化合物，如糖類分解為單糖，蛋白質分解為氨基酸，脂類分解為甘油及脂肪酸。然後這些分解後的營養物質被小腸（主要是空腸）吸收進入體內，進入血液和淋巴液。這種消化過程叫化學性消化。機械性消化和化學性消化兩功能同時進行，共同完成消化過程。
