1、卡勒姆·林奇（邁克爾·法斯賓德飾）在死刑即將執行之前清醒過來，發現他被索菲婭（瑪麗昂·歌迪亞飾）選中，要參加一個能讓人類擺脫暴力沖動的計劃。虛擬現實機器Animus能讓用戶體驗祖先的記憶，被綁在機器上之後，卡勒姆·林奇意識到他是生活在西班牙宗教法庭時期一位殺手的後裔，他們尋找的是可以控制自由意志的伊甸園蘋果。
2、索菲婭被迫於父親艾倫（傑瑞米·艾恩斯飾）的壓力，她不情願地操縱著勒姆·林奇尋找伊甸園蘋果在現代世界的下落，威脅著他身體和心理的健康。但在殺手同行Baptiste（邁克爾·威廉姆斯飾）暗示瞭卡勒姆·林奇，艾倫有可能動機不純之後，卡勒姆·林奇開始重新考慮他的行為和動機，而人類自由意志的命運懸而未決。
