1、形態特征不同。肉蓯蓉:高大草本,高40-160厘米,大部分地下生。莖不分枝或自基部分2-4枝,下部直徑可達5-10(-15)厘米,向上漸變細,直徑2-5厘米。鎖陽:多年生肉質寄生草本,無葉綠素,全株紅棕色,高15-100厘米,大部分埋於沙中。
2、分佈地區不同。肉蓯蓉:內蒙古(阿左旗)、甘肅(昌馬)及新疆。鎖陽:分佈於中國新疆、甘肅、青海、內蒙古、寧夏等地。
3、生長環境不同。肉蓯蓉:喜生於輕度鹽漬化的松軟沙地上,一般生長在沙地或半固定沙丘、幹涸老河床、湖盆低地等,生境條件很差。鎖陽:鎖陽生於荒漠草原、草原化荒漠與荒漠地帶。多在輕度鹽漬化低地、湖盆邊緣、河流沿岸階地、山前洪積、沖積扇緣地生長,土壤為灰漠土、棕漠土、風沙土、鹽土。喜幹旱少雨,具有耐旱的特性。