一般如果乳腺囊腫是非常明確的是囊性的結節，100%是良性問題，也不需要特殊的臨床處理，隻需要觀察就可以瞭，不需要進行手術。有一些特殊類型的囊腫就需要進一步的臨床診斷，比如囊腫特別大、囊腫內部的液體壓力很高、張力較大、囊腫很硬，說明囊腫的內壁細胞可能分泌的液體比較多或者囊壁上可能有一些增殖的細胞，因此囊腫很大的會建議用細針將囊腫內的液體抽出，然後進行細胞學的診斷。如果囊腫是散在的，就是很多地方都有，但是每個囊腫之間間隔的距離很遠，是散在的發生，一般是良性問題。如果囊腫集中在很小的區域裡，有多發的、泡狀的、密集的囊腫，可能並不是囊腫，其實是導管內的多發腫物，就需要取活檢才能明確性質。
