十二指腸潰瘍的治療主要包括一般治療、藥物治療和手術治療。一般治療主要強調的是調整個人的生活習慣，要註意保暖，避免能夠刺激胃酸及胃腸黏膜的藥物和飲食。藥物治療主要包括抑酸劑，有H2受體拮抗劑如雷尼替丁、法莫替丁、西咪替丁等，質子泵抑制劑如蘭索拉唑、泮托拉唑、雷貝拉唑、埃索美拉唑等，黏膜保護劑有中藥和西藥制劑，必要時可加用促胃腸動力劑。目前認為胃和十二指腸潰瘍伴發幽門螺桿菌的感染率較高，且根除幽門螺桿菌對於改善癥狀，預防復發，減少並發癥起到很好的治療作用。一部分患者通過上述治療以及個人生活習慣的改善，疾病的復發明顯減少，甚至治愈。
