小兒衣原體肺炎並不多見，相對支原體肺炎要少。衣原體肺炎也可以發燒，也可以不發燒，因為衣原體感染往往不是很明顯，有些衣原體感染可能存在一過性，有的時候也會漏診，不過現在因為對於衣原體的抗體檢測比較常規化，所以漏診的相對少一點。衣原體肺炎用的藥也是大環內酯類的藥，可以用紅黴素、阿奇黴素治療。衣原體肺炎臨床表現主要是發燒、咳嗽，病原體肺炎有的就是比較輕，當然重的也是有，就是少。如果是典型的肺炎，可能還會有氣急、紫紺，肺裡面可以有體征，可以也沒有體征，可以聽到囉音，也可以沒有囉音，一般衣原體肺炎2-3周就可以康復。
