一般藿香正氣水主要采取的是乙醇滲漉法和水煎煮法制取，所以藿香正氣水的制劑中往往含有乙醇，藿香正氣口服液在生產工藝方面有所提高，采用瞭水回流蒸餾法和水煎煮法，它的浸出制劑中不含乙醇，性味辛、微甜，二者藥效類似。相比藿香正氣水藥性更為峻猛，口感、刺激感強，而藿香正氣口服液不含酒精，口感較好，藥效更為柔和。藿香正氣水和藿香正氣口服液具有相似的名字，從成分上來說，成分都有蒼術、陳皮、厚樸、茯苓、大腹皮、半夏、甘草、白芷、藿香、紫蘇葉等等，都具有解表化濕、理氣和中的作用。但是在臨床使用的時候略有區別，酒精過敏的人群優選藿香正氣口服液。
