口臭的原因有多種，應該針對不同的疾病采取相應的治療措施。如果是口腔疾病，比如牙齦炎、牙周炎和齲齒而引起的口臭，需要進行抗生素治療、牙周潔治以及齲齒修補。如果是胃幽門螺桿菌感染而引起的口臭，應該進行幽門螺桿菌的根除治療，經常采用四聯的根除治療方案。如果是因為腸道菌群失調而引起的口臭，需要進行腸道菌群的調節，可以多飲用酸奶或者服用益生菌類的藥物。如果存在便秘，應該進行通便治療，可以服用緩瀉劑，像乳果糖、聚乙二醇等。如果存在食物消化不良，可以配合使用消化酶，但是如果經過這些處理仍然不能改善口臭的話，應該想到有一些胃腸以及肝膽、胰腺的器質性疾病，會導致口臭，所以應該到醫院檢查除外器質性疾病的原因。
