臨床導致胃炎最主要的病因是幽門螺桿菌感染，幽門螺桿菌在胃內定植，靠尿素酶對胃黏膜有直接的破壞作用，而幽門螺桿菌在胃內引起胃黏膜局部的免疫反應，會導致黏膜的損傷。胃內長期慢性幽門螺桿菌感染，會導致萎縮性胃炎、腸化、異型增生，甚至有個別人會發展到胃癌。另外，導致胃炎的因素還有藥物，現在有大量的人服用阿司匹林或者非甾體抗炎藥，也就是止痛藥。藥物對胃黏膜是有破壞作用的，可以破壞胃黏膜的防禦屏障。酒精可以破壞胃黏膜的防禦屏障，引起胃炎。還有導致胃炎的因素是膽汁反流，由於胃、十二指腸的運動不協調，或者慢性膽囊、膽管疾病，以及膽囊、胃部手術後而造成的膽汁反流，膽汁對胃黏膜有直接的毒性作用而導致胃炎。此外免疫因素會導致胃黏膜的損傷，造成免疫性胃炎。
