試管嬰兒和自然懷孕最主要的不同是試管嬰兒的受精，還有胚胎早期發育是在體外完成，而不是在體內完成，具體如下：1、自然懷孕：需要女性卵巢排出卵子之後，跟精子在輸卵管內相遇並授精，形成受精卵，然後種植到母親的子宮內，在子宮內發育成胚胎，繼續發育。2、試管嬰兒：需要女性通過超促排卵，多個卵泡發育之後經陰道穿刺取卵，將卵子取出之後，跟男方的精子在體外實驗室完成受精的過程，並完成早期胚胎的發育過程。當胚胎發育成第三天的胚胎，或者是第五天、第六天囊胚時，就可以種植到媽媽的子宮內。所以試管嬰兒和自然懷孕最主要不同就是體外受精，還有胚胎早期發育是在體外進行。
