手足口病普通型的病例，早期就是輕微的呼吸道感染癥狀，可以有咳嗽、流鼻涕、食欲不振、惡心、嘔吐、頭疼等癥狀。有一半的病人在發病前的1-2天，或者發病的同時會有發熱，多數在38℃左右。患兒的手、足、口、以及臀部四個部位，出現瞭斑丘疹和皰疹，皮疹的特點是不疼、不癢、不結痂、不落疤。皰疹的周圍可以有一些炎性的紅暈，皰液較少。手足口病的病損在同一個患者不一定全部出現，水皰和皮疹通常在一周內消退。對於重癥的病例可以出現神經系統的受累，呼吸以及循環障礙等表現，有的手足口病臨床表現的患者會有肌陣攣或者腦炎、急性自發性麻痹、心肺衰竭、神經源性水腫等。手足口病流行地區嬰兒雖然沒有手足口病的癥狀，但是出現有發熱，伴有肌陣攣腦炎或者急性弛緩性麻痹、心肺衰竭、腎見液性水腫的少數病例，特別是的嬰兒期感染的患兒，病情兇險，甚至可以致死亡或者留有後遺癥。
