男性小便疼痛一般是由於炎癥、結石、腫瘤、異物以及一些理化因素刺激膀胱和尿道黏膜而引起。尿痛是泌尿外科常見的癥狀，男性很多疾病都會引起排尿疼痛的癥狀，比如尿道炎、膀胱炎、急性與慢性前列腺炎、精囊炎、膀胱結石、尿道結石、膀胱結核等。例如尿道炎患者會出現在排尿的時候，或者是排尿結束的時候出現疼痛癥狀，除瞭疼痛之外，還通常伴有尿道口黏膜紅腫、尿頻、尿急，自尿道外口流出膿性或者是黏液性分泌物的癥狀。如果男性在排尿的時候出現疼痛癥狀，建議到醫院泌尿外科就診，做相關檢查，比如尿常規、泌尿系超聲等，然後針對病因進行相應的治療。
