化膿性腦膜炎的治療首先是抗生素的治療。化膿性腦膜炎預後比較嚴重，力求在24小時之內殺滅腦積液中的致病菌，選擇對病原體比較敏感的，並且通過血腦屏障通透性比較高的藥物。急性期要靜脈給藥，做到用藥要早、劑量要足、療程要夠，療程一般至少要兩周。像金黃色葡萄球菌，或者革蘭氏陰性桿菌或腦膜炎，療程要在21天以上，如果有並發癥或者不規則的治療，應該適當的延長療程。第二個，要維持水電解質平衡及其合理的營養。第三個，要註意控制腦水腫及顱內壓增高，要限制液體的入量。靜脈可以用一些脫水藥物，治療要控制驚厥的發作，如果患兒有驚厥，可以用地西泮、苯巴比妥、左乙拉西坦這些藥物。要維持心血管及心功能的正常，要監測心肺功能。並發癥的治療，如果出現化膿性腦膜炎，有並發癥要做相應處理，像硬膜下積液要穿刺放液，如果有腦積水，要做腦室-腹腔分流術。化膿性腦膜炎導致的驚厥，抗驚厥的藥物必須在醫生的嚴格的指導下服用。
