1、概念不同，發酵乳：發酵乳(酸乳)就是乳和乳制品在特征菌的作用下發酵而成的酸性凝乳狀制品，該類產品在保質期內的特征菌必須大量存在，能繼續存活且具有活性。酸奶：酸奶是以牛奶為原料，經過巴氏殺菌後再向牛奶中添加有益菌（發酵劑），經發酵後，再冷卻灌裝的一種牛奶制品。
2、原料不同，發酵乳：乳和乳制品。酸奶：鮮牛奶，白糖，全脂乳粉，水。
3、種類，發酵乳：發酵乳是一類乳制品的綜合名稱，種類很多，包括酸奶、開菲爾、發酵酪乳、酸奶油、乳酒(以馬乳為主)等。酸奶：根據國傢標準，酸奶可分為4類:酸乳、發酵乳、風味酸乳、風味發酵乳。酸乳是以生牛(羊)乳或乳粉為原料，經殺菌、接種嗜熱鏈球菌和保加利亞乳桿菌(德氏乳桿菌保加利亞亞種)發酵制成的產品。發酵乳是以生牛(羊)乳或乳粉為原料，經殺菌、發酵後制成的pH值降低的產品，沒有菌的限定。
