1、檸檬籽種出小盆栽，首先選種是關鍵。要選用已充分成熟的檸檬，不能選用沒有熟透的，因為這種果實的種子發芽率比較低。然後剝出飽滿粒大且完整的檸檬籽。
2、用清水將檸檬籽上面殘留的果肉和汁液清洗幹凈，不能有殘留。清洗時需註意不能弄傷它的出芽點，即種子微尖的部分。再把它們放入清水中浸泡，每天換一次水，大約7天左右就能發芽。
3、由於檸檬喜歡溫暖濕潤的環境下生長，而且喜歡排水性良好。將催芽後的檸檬籽放入盆內，然後在壤表面鋪蓋一層粗砂，澆入適量的水分，保持壤濕潤即可。栽種後約一周左右就能長出小苗，等再生長一段時間後需進行間苗，把一些生長細弱和較濃密的小苗拔掉，以保證養分能集中供給，小苗生長更好。
4、如果檸檬盆栽養護的好，來年檸檬樹苗就可以長高至與其他花卉植物相當的規模，此時養護方法也和其他綠植一樣，為它施肥剪枝，澆水除蟲，更換更大的盆。
