1、含義不同：錄取分數線即招生院校按計劃錄取完成後的最低分數線或者是分專業最低分數線。投檔線指以院校為單位，按招生院校同一科類（如文科或理科）招生計劃數的一定比例（即投檔比例1：1.2以內），在對第一志願投檔過程中自然形成的院校調檔最低成績標準。每一所院校都有自己的投檔分數線，簡稱投檔線。
2、錄取情況不同：錄取分數線是院校錄取完成後形成的最低分數線，而另一個投檔線是院校投檔完成後形成的最低分數線。事實上，達到投檔線隻是獲得瞭進學校的初步資格，是否能被錄取，還得看所填報的專業。不同專業之間分差較大，如果考生的成績沒有達到所填報專業的分數線，那麼同樣不能被錄取。
3、特殊情況不同：填報瞭相同的專業，但是分數比自己低的考生反而能被錄取，自己卻被退檔。這和是否填報瞭專業服從有關。一些考生雖然沒有達到所填報專業的分數線，但是達到投檔線後，如果專業服從，學校會將其調劑到其他生源不充足的專業，同樣可以被錄取到該校。
